明朝太仆寺的主要职能是管理全国的马政。太仆寺卿是太仆寺的长官，从三品。

太仆寺一般设有：卿一人，从三品；少卿二人，从四品上；丞四人，从六品上；主簿二人，从七品上；录事二人。下属各部门分别掌管不同身份的人的马匹。车府署，掌王公以下车路及驯驭之法；东宫九牧监，掌牧养马牛，以供皇太子之用。