硅藻泥有易脏污、不易清洁和保养等缺点，因为硅藻泥被誉为会呼吸的墙面，这同时也是它的缺陷所在，蜂窝状的结构将室内灰尘连带水分一起吸附，表面容易积累灰尘，墙壁颜色会变得脏乱。内部水分过多的话，会成为细菌等微生物发育地，危害到室内环境。