由于各种因素的影响，以及不可预期性的影响，造成了预结算工作存在一些问题，首先是偷工减料的问题，在建筑工程中，材料的供应是有规定限制的，但是价格方面，会随着市场变化而变动，有些建筑施工单位只看重经济效益，不重视材料质量和工程本身的质量，使用质量比较差的产品，为了获得更多经济效益，出现项目的取消或者变更，不进行上报，工程预结算结果就会增加。一些施工单位在小部分工程中，用议价的方式代替定额报价的形式，这样也会在工程预结算中出现虚价。由于工期限制，有的施工单位就以此为条件，向建筑公司索要其他费用，在工程进行中，制造各种理由索要费用。