吉首大学的专业有:人力资源管理、工程管理、林业技术、钻井技术、油气开采技术、油气储运技术、油田化学应用技术、石油工程技术、机械设计与制造、数控技术、模具设计与制造、工业设计、机电设备维修与管理、机电一体化技术、汽车制造与装配技术、汽车电子技术、建筑设计、建筑装饰工程技术、建筑工程技术、工程造价、市政工程技术、物业管理等等。

1. 电子信息工程专业

2. 土木工程专业

3. 计算机科学与技术专业

4. 环境科学与工程专业

5. 国际经济与贸易专业

6. 机械设计制造及其自动化专业

7. 软件工程专业

8. 数学与应用数学专业

9. 物流管理专业

10. 旅游管理专业

现在的吉首大学是由原来的吉首大学合并了湘西州人民医院、张家界市武陵高等专科学院和吉首卫生学校的一所湖南省高等教育学校。在有评估的47个本科专业中，以音乐学为最好的专业，全国排在第24名，是唯一的一个A等级专业；其次的B+等级专业有小学教育、民族传统体育、工商管理、市场营销。这5个专业可以算是吉首大学最好的5个专业了。