收取员工罚款主要通过营业外收入科目进行核算，具体的账务处理如下：

发放工资，扣罚款时：

借：应付职工薪酬—应付职工工资，

贷：其他应收款—罚款，

银行存款，

罚款结转到营业外收入时，

借：其他应收款—罚款，

贷：营业外收入。