1、工作任务不同，中统的工作重心是监控***机关内部情况；打击一切***之外的党派；控制社会舆论和思想。军统主要任务是收集各类情报、对军队监视整治，对敌对势力逮捕暗***。

2、所属机构不同，中统的是党中央的情报机构。军统的是直接属于***军队序列。

3、管辖领域不同，军统主要管辖军队、警宪以及各地的交通部门。中统主要管辖的就是***的党务问题以及全国各地的行政机关以及学校的党务问题，还有社会上的教化舆论。