科属差异：

藿香蓟和假臭草虽然同属菊科，但藿香蓟属于胜红蓟属；而假臭草属于泽兰属，它们俩同科不同属。

叶片不同：

藿香蓟的叶为阔卵形或卵形，叶形较圆润，锯齿比较钝，边缘锯齿不明显；而假臭草的叶为卵形、宽卵形或菱形，叶形较尖，边缘锯齿明显。在叶片气味方面，假臭草的叶片揉搓后可以闻到一种类似猫尿的***性味道，而藿香蓟的气味比较淡。

总苞不同：

藿香蓟的总苞呈杯状；而假臭草的则呈长筒形或钟形。