清华大学水利水电工程学院最好。

清华大学水利水电工程系建于1952年，其前身是清华大学土木工程系水利组。水利系的学科布局覆盖水利工程一级学科的全部二级学科，以及归属于土木工程一级学科的岩土工程学科和归属于管理科学与工程一级学科的建设项目管理学科，其中水工结构工程与水力学及河流动力学为全国重点学科。水利工程一级学科在2003年教育部组织的一级学科评估中综合排名全国靠前，并于2007年首批被认定为全国重点学科。