1、编制不同：正科级是干部编制、公务员编制，正科职可以是公务员编制也可以是事业单位编制。

2、对象不同：正科级的对象包括正科领导岗位上的人员、从正科领导岗位上退到二线的人员和享受正科待遇的其他人员。正科职的对象为正科领导岗位上的人员。

3、代表意义不同：正科级是代表一个人的待遇级别，正科职是代表一个人的职位。