1、花朵区别：树番茄聚伞式花序近腋生或腋外生长，花梗长1到2厘米 花萼呈辐状，直径大约6毫米，长有短绒毛。花冠呈辐状，粉红色，直径在1.5到2厘米，具有5深裂，裂片呈披针形。番茄花朵黄色，花冠辐状，直径在2厘米左右，花萼裂片呈披针形。

2、果实区别：树番茄果实呈卵状，汁液多，长大约5到7厘米，表面光滑，颜色呈桔黄色或带红色。番茄浆果扁球形或近球形，肉质，多汁液，颜色呈桔黄色或鲜红色，表面光滑。