公积金余额是不会清零的，除非职工办理退休提取或是迁移公积金，其他情况公积金都是公民的合法财产，不会被清零。但是公积金是有可能封存的，公积金账户无法转移，且又不符合销户提取住房公积金条件时，中断缴存的住房公积金账户应予封存。