主要特征有：

1、原生动物是自然界中最原始、最简单、最低等的动物类群。个体多数是由单个细胞构成的，少数是由多个具有相对独立的细胞聚集而成的群体。

2、原生动物的功能分化是靠细胞器完成的，如鞭毛、纤毛、伪足等为其运动胞器。

3、营养方式是光合营养、吞噬营养和渗透营养三类。

4、生殖方式是有性生殖和无性生殖两大类，前者有配子生殖和接合生殖；后者有二分裂、多分裂（如裂体生殖和孢子生殖）、出芽生殖及质裂等。

5、多数以形成包囊渡过不良环境。