《我的世界神奇宝贝》普通系没有克制的属性，但会被格斗系克制。格斗系克制普通系、岩石系、钢系、冰系、恶系，会被飞行系、超能力系、妖精系克制。飞行系克制格斗系、虫系、草系，会被岩石系、电系、冰系克制。毒系克制草系、妖精系，会被地面系、超能力系克制。